Prøvetagning af spildevand kan være tidskrævende. John Eisele/Colorado State University
Mikrobiologer Susan De Long , Carol Wilusz mødtes og blev spildevandsaficionados i april 2020, da en græsrodsgruppe af spildevandsrensningsanlægsoperatører bad dem om at udvikle og implementere en test til at påvise SARS-CoV-2 i prøver fra Colorados kloakker. De Long er en miljøingeniør, der studerer nyttige bakterier. Wilusz' ekspertise er inden for RNA-biologi. Her beskriver de, hvordan spildevandsovervågning fungerer, og hvad det kan gøre i en post-pandemisk fremtid.
Hvordan overvåges spildevand for SARS-CoV-2?
Spildevandsovervågning udnytter det faktum, at mange menneskelige patogener og produkter af humant stofskifte ender i urin, afføring eller begge dele. SARS-CoV-2-virussen, der forårsager COVID-19, dukker overraskende op store mængder i afføring fra inficerede mennesker, selvom dette ikke er en væsentlig sygdomsoverførselsvej.
For at finde ud af, om der er patogener til stede, skal vi først indsamle en repræsentativ prøve af spildevand, enten direkte fra kloakken eller på det punkt, hvor det, ingeniører kalder "influent", kommer ind i et renseanlæg. Vi kan også bruge faste stoffer, der har bundfældet sig fra spildevandet.
Teknikere skal derefter fjerne store partikler af fækalt materiale og koncentrere eventuelle mikrober eller vira. Det næste trin er at udvinde deres nukleinsyrer – det DNA eller RNA, der rummer patogenernes genetiske information.
Sekvenserne indeholdt i DNA'et eller RNA'et fungerer som unikke stregkoder for de tilstedeværende patogener. For eksempel, hvis vi opdager gener, der er unikke for SARS-CoV-2, ved vi, at coronavirus er i vores prøve. Vi bruger PCR-baserede tilgange, der ligner dem bruges i kliniske diagnostiske tests, for at detektere og kvantificere SARS-CoV-2-sekvenser.
Karakterisering af nukleinsyresekvensen mere detaljeret kan give information om virale stammer – f.eks. den kan identificere varianter ligesom omicron BA.2.
I øjeblikket er langt størstedelen af spildevandsovervågningsindsatsen fokuseret på SARS-CoV-2, men de samme teknikker virker med andre patogener, bl.a. poliovirus, indflydelse , norovirus.
Før pandemien var en ansøgning overvågning for sjældne poliovirusudbrud i områder, hvor poliovaccination er i gang. Spildevand kan også overvåges for tegn på forskellige lægemidler for at give indsigt i niveau og type af stofbrug i en befolkning.
Hvor bliver dataene af?
Under pandemien udviklede US Centers for Disease Control and Prevention Nationalt spildevandsovervågningssystem specifikt for at spore SARS-CoV-2 over hele landet. Over 800 websteder rapporterer data til dette NWSS-system, men ikke alle stater og amter er i øjeblikket repræsenteret.
Mere end 800 steder, der dækker populationer af forskellige størrelser, rapporterer COVID-19-spildevandsnumre til CDC. CDC COVID -datatracker, CC BY
Mange statslige myndigheder, som f.eks Colorado Department of Public Health and Environment, og byer, som Tempe, Arizona, har deres egne dashboards til rapportering af data. Nogle virksomheder, der udfører spildevandsanalyse, rapporterer data på deres egne dashboards, Også.
Efter vores mening repræsenterer NWSS et spændende første skridt i overvågning af befolkningens sundhed gennem spildevand. Lignende systemer er ved at blive etableret i andre lande, inklusive Australien , New Zealand.
Hvad viser spildevandsdata egentlig?
SARS-CoV-2-niveauer i spildevand fra store populationer er en glimrende indikator for infektionsniveauet i et samfund. Systemet overvåger automatisk alle, der bor i kloakken, så det er anonymt, uvildigt og retfærdigt. Det er vigtigt, at det også er umuligt at spore infektionen tilbage til en bestemt person, husstand eller nabolag uden at tage yderligere prøver.
Spildevandsovervågning er ikke afhængig af tilgængeligheden af kliniske tests eller personer, der rapporterer deres testresultater. Det opfanger også asymptomatiske og præsymptomatiske tilfælde af COVID-19; dette er kritisk, fordi folk, der er smittet, men ikke føler sig syg, kan stadig sprede COVID-19.
Efter vores mening er spildevandstestning stadig vigtigere, efterhånden som flere COVID-19 tests udføres derhjemme. Og fordi vaccination også har ført til mere milde og asymptomatiske tilfælde af COVID-19, kan folk blive smittet uden overhovedet at blive testet. Disse faktorer betyder, at data fra kliniske tilfælde er mindre informative end tidligere i pandemien, mens spildevandsdata forbliver en konsekvent indikator for infektionsniveauet i lokalsamfundet. Spildevandsovervågning er ikke afhængig af, at folk rapporterer en positiv hjemmetest eller endda er opmærksomme på deres infektioner. Spencer Platt/Getty Images News
Indtil videre kan du ikke præcist forudsige antallet af inficerede individer i et samfund baseret på niveauet af virus i dets spildevand. Stadiet af en persons infektion, hvordan deres krop reagerer på virussen, den virale variant, hvor langt en person var fra hvor spildevandsprøven blev taget, selv vejret kan alle påvirke mængden af SARS-CoV-2 målt i spildevand.
Men forskere kan udlede relative ændringer i infektionsraten. At se virale niveauer gå op og ned i spildevand giver et glimt af, om tilfældene stiger eller falder i samfundet som helhed.
Fordi SARS-CoV-2 kan påvises i spildevandsdage eller endda uger før udbrud opstår, kan spildevandsovervågning give en tidlig advarsel om, at folkesundhedsforanstaltninger kan være berettiget. Og tendenser i signalet er vigtige – hvis du ved, at niveauerne stiger, kan det være et godt tidspunkt at genindføre et maskemandat eller anbefale at arbejde hjemmefra. På nuværende tidspunkt bruger offentlige sundhedsmyndigheder spildevandsovervågningsdata sammen med andre oplysninger som test positivitetsrater og antallet af kliniske tilfælde og hospitalsindlæggelser i samfundet for at træffe denne slags beslutninger.
Data fra sekventering kan også hjælpe med at opdage nye varianter og overvåge deres niveauer, hvilket gør det muligt for helbredsreaktioner at tage hensyn til den tilstedeværende variants karakteristika.
I mindre befolkningsgrupper, såsom i kollegier og plejehjem, kan spildevandsovervågning opdage et lille antal inficerede mennesker. Det kan slå alarm om, at målrettet klinisk test er for at identificere inficerede mennesker til isolation. Tidlig opdagelse, målrettet testning og karantæne er effektiv til at forebygge udbrud. I stedet for at bruge kliniske tests til rutinemæssig overvågning, kan administratorer reservere forstyrrende kliniske tests til tidspunkter, hvor SARS-CoV-2 detekteres i spildevandet.
Hvordan vil overvågning se ud i fremtiden?
Udbredt og rutinemæssig brug af spildevandsovervågning ville give offentlige sundhedsembedsmænd adgang til information om niveauet af en række potentielle infektioner i amerikanske samfund. Disse data kan vejlede beslutninger om, hvor der skal stilles yderligere ressourcer til rådighed for lokalsamfund, såsom at afholde test- eller vaccinationsklinikker på steder, hvor infektionen er stigende. Det kan også hjælpe med at afgøre, hvornår interventioner som maskering eller skolelukninger er nødvendige.
I bedste tilfælde kan spildevandsovervågning fange en ny virus, når den først ankommer til et nyt område; en tidlig nedlukning i det meget lokaliserede område kan potentielt forhindre en fremtidig pandemi. Interessant nok har forskere opdaget SARS-CoV-2 i arkiverede spildevandsprøver indsamlet før nogen var blevet diagnosticeret med COVID-19. Hvis spildevandsovervågning havde været en del af den etablerede folkesundhedsinfrastruktur tilbage i slutningen af 2019, kunne det have givet en tidligere advarsel om, at SARS-CoV-2 var ved at blive en global trussel.
Indtil videre er etablering og drift af et nationalt spildevandsovervågningssystem, især et, der inkluderer overvågning på bygningsniveau på nøglesteder, stadig for dyrt og arbejdskrævende.
Igangværende forsknings- og udviklingsindsatser forsøger at forenkle og automatisere spildevandsprøvetagning. På analysesiden vil tilpasning af PCR- og sekventeringsteknologier til at påvise andre patogener, herunder nye, være afgørende for at drage fuld fordel af et sådant system. I sidste ende kan spildevandsovervågning hjælpe med at understøtte en fremtid, hvor pandemier er langt mindre dødelige og har mindre sociale og økonomiske konsekvenser.
Om forfatterne
Susan De Long, lektor i bygnings- og miljøteknik, Colorado State University , Carol Wilusz, professor i mikrobiologi, immunologi og patologi, Colorado State University
Denne artikel er genudgivet fra The Conversation under en Creative Commons-licens. Læs oprindelige artikel.
Relaterede Bøger:
Kroppen holder scoren: Hjernens sind og krop i helingen af traumer
af Bessel van der Kolk
Denne bog udforsker forbindelserne mellem traumer og fysisk og mental sundhed, og tilbyder indsigt og strategier for helbredelse og bedring.
Klik for mere info eller for at bestille
Breath: The New Science of a Lost Art
af James Nestor
Denne bog udforsker videnskaben og praksisen med åndedræt og tilbyder indsigt og teknikker til at forbedre fysisk og mental sundhed.
Klik for mere info eller for at bestille
Planteparadokset: De skjulte farer ved "sunde" fødevarer, der forårsager sygdom og vægtøgning
af Steven R. Gundry
Denne bog udforsker forbindelserne mellem kost, sundhed og sygdom, og tilbyder indsigt og strategier til at forbedre den generelle sundhed og velvære.
Klik for mere info eller for at bestille
Immunitetskoden: Det nye paradigme for ægte sundhed og radikal anti-aldring
af Joel Greene
Denne bog tilbyder et nyt perspektiv på sundhed og immunitet, der trækker på principper for epigenetik og tilbyder indsigt og strategier til at optimere sundhed og aldring.
Klik for mere info eller for at bestille
Den komplette guide til faste: Helbred din krop gennem intermitterende, alternativ-dages og forlænget faste
af Dr. Jason Fung og Jimmy Moore
Denne bog udforsker videnskaben og praksis med faste og tilbyder indsigt og strategier til forbedring af den generelle sundhed og velvære.
